Detalles de la búsqueda
1.
Deep enhanced constraint clustering based on contrastive learning for scRNA-seq data.
Brief Bioinform
; 24(4)2023 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37313714
2.
DMFDDI: deep multimodal fusion for drug-drug interaction prediction.
Brief Bioinform
; 24(6)2023 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37930025
3.
Entropy-based inference of transition states and cellular trajectory for single-cell transcriptomics.
Brief Bioinform
; 23(4)2022 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35696651
4.
Deep structural clustering for single-cell RNA-seq data jointly through autoencoder and graph neural network.
Brief Bioinform
; 23(2)2022 03 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35172334
5.
Predicting synergistic anticancer drug combination based on low-rank global attention mechanism and bilinear predictor.
Bioinformatics
; 39(10)2023 10 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37812255
6.
DEEPSEN: a convolutional neural network based method for super-enhancer prediction.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 15): 598, 2019 Dec 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31874597
7.
Genome-wide analysis of epigenetic dynamics across human developmental stages and tissues.
BMC Genomics
; 20(Suppl 2): 221, 2019 Apr 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30967107
8.
A new method for enhancer prediction based on deep belief network.
BMC Bioinformatics
; 18(Suppl 12): 418, 2017 Oct 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29072144
9.
iHMS: a database integrating human histone modification data across developmental stages and tissues.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 103, 2017 Feb 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28187703
10.
Dynamic epigenetic mode analysis using spatial temporal clustering.
BMC Bioinformatics
; 17(Suppl 17): 537, 2016 Dec 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28155634
11.
A comparison study on feature selection of DNA structural properties for promoter prediction.
BMC Bioinformatics
; 13: 4, 2012 Jan 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22226192
12.
Structural features based genome-wide characterization and prediction of nucleosome organization.
BMC Bioinformatics
; 13: 49, 2012 Mar 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22449207
13.
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell Transcriptomic Data Using Bidirectional RNN.
Front Oncol
; 12: 899825, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35692809
14.
TiC2D: Trajectory Inference From Single-Cell RNA-Seq Data Using Consensus Clustering.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 19(4): 2512-2522, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33630737
15.
Inferring gene regulatory network from single-cell transcriptomic data by integrating multiple prior networks.
Comput Biol Chem
; 93: 107512, 2021 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34044202
16.
A pattern-based nearest neighbor search approach for promoter prediction using DNA structural profiles.
Bioinformatics
; 25(16): 2006-12, 2009 Aug 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19515962
17.
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy.
Front Cell Dev Biol
; 8: 588041, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33195248
18.
TriPCE: A Novel Tri-Clustering Algorithm for Identifying Pan-Cancer Epigenetic Patterns.
Front Genet
; 10: 1298, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32010182
19.
Identification of cancer subtypes from single-cell RNA-seq data using a consensus clustering method.
BMC Med Genomics
; 11(Suppl 6): 117, 2018 Dec 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30598115
20.
Identifying Cis-Regulatory Elements and Modules Using Conditional Random Fields.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 11(1): 73-82, 2014.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26355509